请问在绑定自己的域名后，是不是线上的APP就不能正常获取到API接口数据了，需要更新一版？

绑定 API 域名以后，需要更新代码，文档参考： https://leancloud.cn/docs/custom-api-domain-guide.html#hash8108451145

另外在绑定自己域名后是只需要把这里替换成自己绑定的域名就可以像之前一样正常访问了？

是的，需要在代码中替换成自己的域名。参考上面的文档链接，有相关代码示例。

还有这里为什么文件访问域名还没法绑定呢？

文件域名绑定参考：文件域名绑定指南4。
请前往 控制台 > 存储 > 设置 > 自定义文件域名 绑定文件域名。